Милена Банковска завършва средното си образование през 2011г. в 1 СОУ “Пенчо П. Славейков” в гр. София с профилирано изучаване на „Рисуване и испански език“ като владее и английски език. През 2016г. придобива бакалавърска степен по „Педагогика на обучението по изобразително изкуство“ в СУ "Св. Климент Охридски". Продължава образованието си в СУ като през 2017г. като получава диплома за магистър по „Образователен мениджмънт“.
През 2020г. придобива магистърска степен в НБУ - „Плакат и комуникативен дизайн“, а от 2021г. е и магистър по специалност „Дигитален маркетинг и уеб дизайн“ в УниБит.
Милена Банковска е асистент в катедра Информационни системи и технологи към Университет по библиотекознание и информационни технологии. Провежда учебни занятия по дисциплините „Основи на уеб програмирането“ и „Системи за графичен дизайн“ в бакалавърските специалности по професионално направление 4.6. Информатика и компютърни науки в УниБИТ.
През октомври 2022 г. е зачислена като редовен докторант в професионално направление: 4.6 „Информатика и компютърни науки“, докторска програма: „Информационни системи и технологии, информатика и компютърни науки“, към Институт за научни изследвания и обучение на докторанти на УниБИТ, като разработваната от нея тема изследва визуалния дизайн на уеб базираните електронни среди за обучение и тяхното влияние върху обучаемите.